Город Щербинка расположен в Московской области Российской Федерации.
Территория города характеризуется равнинным, слегка всхолмленным характером местности. Восточная часть города (южная промзона и благоустроенная многоэтажная жилая застройка) привязана к наиболее возвышенным частям рельефа, западная часть города - к более низким частям рельефа. Перепад высот на территории не превышает 20-40 м на 1 км. Среднегодовое количество осадков в виде дождя и снега составляет 710 мм, а максимум осадков приходится на июль и сентябрь-октябрь месяцы, достигая величины 130-150 мм.Район размещения г. Щербинки, как и всей Московской области, характеризуется умеренными климатическими условиями. Ближайшие пункты контроля климатических, метеорологических условий и фонового загрязнения атмосферы органов Роскомгидромета находятся в г. Москве (пос. Ленино-Дачное) на расстоянии четыре км, в направлении на север, и в г. Подольске на расстоянии 16 км, в направлении на юг.